PhD Position – AI-based Multi-Omics in Computational Biomedicine (m/f/d)

Stammzellbiologie
25.025 Stunden
auf 36 Monate befristet
ab 01.04.2026
Eingruppierung gemäß TV-L
Bewerbungsfrist 31.03.2026
Universitätsklinikum Erlangen
Department of Stem Cell Biology
Dr. Pooja Gupta
Kussmaulallee 4
91054 Erlangen
Ansprechperson bei Fragen
Dr. Pooja Gupta
Group Leader
Telefon: 09131 85-42840
PhD Position – AI-based Multi-Omics in Computational Biomedicine (m/f/d)
Veröffentlicht seit: 23.02.2026
Job-Nr.: 12390
Ansprechperson bei Fragen
Dr. Pooja Gupta
Group Leader
Telefon: 09131 85-42840
Anschrift
Universitätsklinikum Erlangen
Department of Stem Cell Biology
Dr. Pooja Gupta
Kussmaulallee 4
91054 Erlangen
PhD Position – AI-based Multi-Omics in Computational Biomedicine (m/f/d)
Veröffentlicht seit: 23.02.2026
Job-Nr.: 12390
Universitätsklinikum Erlangen
Department of Stem Cell Biology
Dr. Pooja Gupta
Kussmaulallee 4
91054 Erlangen
Ansprechperson bei Fragen
Dr. Pooja Gupta
Group Leader
Telefon: 09131 85-42840

Klingt spannend?

Das sind wir:
Patient care at the highest level, excellent research and teaching, and cutting-edge medicine and diagnostics – that is Universitätsklinikum Erlangen. With more than 10,000 highly qualified employees, we are one of the largest employers in the region and continue to grow. Through scientific excellence and strong commitment, we offer our patients innovative and future-oriented treatment options and actively contribute to medical progress.

The Department of Stem Cell Biology at Universitätsklinikum Erlangen invites applications for a PhD position in a newly established research group in Bioinformatics for Multi-Omics. The PhD project is part of a BMFTR-funded research initiative applying artificial intelligence to integrate multi-omics data for biomarker discovery in Parkinson’s disease (PD) and inflammatory bowel disease (IBD).

Your tasks:
Analyze large-scale transcriptomic, proteomic, and metabolomic datasets
Implement and evaluate machine learning models for disease subtyping and biomarker discovery
Contribute to the construction of multi-layer molecular networks
Work closely with clinicians and wet-lab researchers
Present results at international conferences and publish in peer-reviewed journals

Essential experience/qualifications:
Master’s degree in Bioinformatics, Computational Biology, Computer Science, Data Science, Systems Biology, or a closely related quantitative field
Solid programming skills in Python and/or R (experience with scientific libraries and data analysis workflows is required)
Strong foundation in statistics and machine learning
Prior experience with high-throughput biological data (e.g., RNA-seq, proteomics, metabolomics)
Experience with Linux/HPC environments and version control (Git) is highly desirable
Demonstrated interest in AI-driven biomedical research and translational applications
Ability to work independently and in an interdisciplinary team
Very good English communication skills (written and spoken)

We offer:
A secure and stable position with all the benefits of a public sector collective agreement, including additional pension coverage through the Federal and State Pension Scheme (VBL), as a system-relevant public employer
An interesting and varied position in a motivated and open-minded team
Structured onboarding and qualified training
A comprehensive health promotion program
Salary classification according to the collective agreement for the public service of the German states (TV-L), depending on qualifications and personal requirements

Arbeiten am UKER

Wir zählen zu den besten Krankenhäusern Deutschlands und sind einer der größten Arbeitgeber in Mittelfranken. Diesen Erfolg erarbeiten tagtäglich unsere über 10.000 hoch qualifizierten Beschäftigten in unterschiedlichsten Berufen. Wir als Uniklinikum Erlangen wissen, dass alle unsere Beschäftigten wichtig sind, damit auch in Zukunft modernste Medizin, ausgezeichnete Forschung und Patientenversorgung auf höchstem Niveau gelingen.

Wenn Sie sich eine Tätigkeit mit einem hohen sozialen Wert wünschen und die Welt der Spitzenmedizin mit uns gemeinsam gestalten und ermöglichen möchten, dann sind Sie bei uns richtig!

Was meinen Sie? Passen wir zu Ihnen und Sie zu uns ans Uniklinikum Erlangen?

Arbeiten am Puls der Medizin
Sinnvoll und systemrelevant
Berufliche Perspektiven
Vorteile eines Tarifvertrages